"Nagu me kõik teame, on PCR biokeemilistes laborites põhiline eksperimentaalne meetod." Katsetulemused on alati ebarahuldavad, mis võib olla tingitud PCR-i plastist kulumaterjalide vähesest saastumisest või inhibiitorite kasutuselevõtust põhjustatud eksperimentaalsetest häiretest. On veel üks väga oluline põhjus: kulumaterjalide ebaõige valik avaldab samuti suurt mõju katsetulemustele.
Põhjuseid, mis mõjutavad PCR-katsete tulemusi, on palju: tavaliselt on neid 7 tüüpi.
1. Praimerid: praimerid on PCR spetsiifilise reaktsiooni võti ning PCR-i produktide spetsiifilisus sõltub praimerite ja matriitsi DNA vahelise komplementaarsuse astmest;
2. Ensüüm ja selle kontsentratsioon;
3. dNTP kvaliteet ja kontsentratsioon;
4. Matriits (sihtgeen) nukleiinhape;
5. Mg2+ kontsentratsioon;
6. Temperatuuri ja aja seadistamine;
7. Tsüklite arv;
8. Seadmed, kulumaterjalid jne.
Paljude mõjutegurite hulgas on tarbekaubad üks väga olulisi ja kergesti tähelepanuta jäetud tegureid.
On palju liike
PCR tarbekaubad: 8 katsutit, väikesemahulised katsutid, standardklaasid, ääristamata, poolseelikuga, täisribaga ning rida PCR- ja qPCR-plaate. Valida on väga raske ja ühiseid probleeme on palju, vaatame probleeme, mida igaüks valib
PCR tarbekaubadja kuidas neid lahendada?
Miks on
PCR tarbekaubadüldiselt valmistatud PP-st?
Vastus: PCR/qPCR kulumaterjalid on üldjuhul valmistatud polüpropüleenist (PP), kuna tegemist on bioloogiliselt inertse materjaliga, pind ei kleepu kergesti biomolekulidele ning sellel on hea keemiline vastupidavus ja temperatuuritaluvus (saab autoklaavida 121 kraadi juures) bakterid ja talub ka temperatuurimuutusi termilise tsükli ajal). Need materjalid on tavaliselt otseses kontaktis reaktiivide või proovidega, mistõttu tuleb tootmis- ja ettevalmistusprotsessi käigus valida kvaliteetsed materjalid ja head töötlemistehnikad.